Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACSIN1Q9BY11 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACSIN1Q9BY11 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms