Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC4A5Q9BY07 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms