Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
RNF17Q9BXT8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
RNF17Q9BXT8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RNF17Q9BXT8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms