Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LSM14BQ9BX40 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSM14BQ9BX40 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms