Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KATNB1Q9BVA0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KATNB1Q9BVA0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms