Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTKNQ9BST9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTKNQ9BST9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms