Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC39A3Q9BRY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC39A3Q9BRY0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms