Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITX2Q99697 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms