Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UHRF1Q96T88 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms