Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRAPPC9Q96Q05 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRAPPC9Q96Q05 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms