Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPRD1AQ96P16 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPRD1AQ96P16 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms