Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCLT1Q96NL6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCLT1Q96NL6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms