Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C9orf72Q96LT7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C9orf72Q96LT7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms