Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPNS2Q96L46 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPNS2Q96L46 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPNS2Q96L46 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms