Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PHACTR3Q96KR7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PHACTR3Q96KR7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms