Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPGRIP1Q96KN7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPGRIP1Q96KN7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms