Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT2BQ96GJ1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT2BQ96GJ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms