Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
OTUB1Q96FW1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
OTUB1Q96FW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms