Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RRP36Q96EU6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RRP36Q96EU6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms