Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MFSD3Q96ES6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms