Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRRFQ96E11 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRRFQ96E11 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms