Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NSUN4Q96CB9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NSUN4Q96CB9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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