Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC17Q96AE7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC17Q96AE7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms