Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRF1Q92994 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRF1Q92994 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms