Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DNAAF4Q8WXU2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms