Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSPC1Q8WXF1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSPC1Q8WXF1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms