Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCG3Q8WXD2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCG3Q8WXD2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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