Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PALLDQ8WX93 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms