Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BRSK1Q8TDC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BRSK1Q8TDC3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms