Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SEMA6DQ8NFY4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SEMA6DQ8NFY4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms