Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DNERQ8NFT8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DNERQ8NFT8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms