Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF397Q8NF99 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF397Q8NF99 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms