Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CSNK2A3Q8NEV1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CSNK2A3Q8NEV1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms