Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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ZNF548Q8NEK5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF548Q8NEK5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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