Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TTC21AQ8NDW8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TTC21AQ8NDW8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
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