Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MSANTD4Q8NCY6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSANTD4Q8NCY6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms