Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC197Q8NCU1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC197Q8NCU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms