Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C12orf29Q8N999 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C12orf29Q8N999 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms