Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IGSF1Q8N6C5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGSF1Q8N6C5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms