Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MSL3Q8N5Y2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MSL3Q8N5Y2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms