Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZCCHC9Q8N567 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms