Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM199Q8N511 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM199Q8N511 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms