Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP3Q8IZU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP3Q8IZU3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms