Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYK2

CCDC105, Coiled-coil domain-containing protein 105, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC105Q8IYK2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC105Q8IYK2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC105Q8IYK2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms