Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDKL3Q8IVW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDKL3Q8IVW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms