Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC9A9Q8IVB4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC9A9Q8IVB4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms