Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM17Q86X19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TMEM17Q86X19 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms