Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPBP1Q86WP2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPBP1Q86WP2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms