Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
N4BP2Q86UW6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
N4BP2Q86UW6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms