Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAPPC11Q7Z392 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC11Q7Z392 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms